面对汽车违章扣分40分的情况，您可以按照以下步骤进行处理：
携带相关证件（驾驶证、身份证、行驶证）到交警队或车管所处理违章行为，并缴纳相应的罚款。请注意，罚款必须在15日内缴纳，否则会产生滞纳金。
在一个记分周期内，累积记分达到40分，需要先进行科目一（道路交通安全法律、法规和相关知识）的学习，然后参加车管所安排的科目一考试。考试及格之后，再参加科目三（道路驾驶技能考试）。只有通过科目三考试后，才能清除扣分。
如果您的驾驶证分数不足，可以考虑使用其他驾驶证的剩余积分进行代扣。但请注意，每个驾驶证的分数是有限的，且代扣行为需要符合相关规定。
尽早处理违章行为，避免因多次严重违章而被采取更严厉的措施，如暂扣或吊销机动车驾驶证。
在处理违章时，工作人员会调出您的违法信息，请您确认是否为自己的车辆违法。确认无误后，工作人员会打印处罚决定书，您需要按照决定书上的指示进行后续处理。
交完罚款后，请保留好相关票据，并定期上网查询违法信息是否已消除。如果违法信息仍未消除，请携带交款单子到交警队的法制科说明情况，由工作人员协助处理。
通过以上步骤，您可以妥善处理违章扣分40分的情况，并尽快恢复驾驶证的正常使用。建议您在处理过程中保持耐心，并严格遵守交通法规，以避免再次发生类似情况。
