商业门店出售时需要交纳的税费主要包括以下几项：
增值税的征收率为5%。计算公式为：应纳税额 = （全部价款和价外费用 - 不动产购买原价 / 取得不动产时的作价） ÷ （1 + 5%） × 5%。
这些税费是以增值税等流转税为征收基数。如果缴纳了增值税，则城市维护建设税按照实际缴纳的增值税税额的5%（县城和镇）、7%（市区）和1%（其他地区）计算纳税。教育费附加和地方教育附加分别按照实际缴纳的增值税税额的3%和2%计算缴纳税额。
个人所得税的计算方式有两种：
据实征收：为（土地增值额 - 现土地增值税 - 供楼利息（只能是一手买的才能减去）- 装修发票额）× 20% + 装修发票额 × 5.75%。
核定征收：为转让收入 × 7.5% × 20%。
土地增值税的计算方式根据土地增值额的不同而有所差异，具体分为四个档次：
增值额未超过扣除项目金额50%的部分，税率为30%。
增值额超过扣除项目金额50%但未超过扣除项目金额100%的部分，税率为40%。
增值额超过扣除项目金额100%但未超过扣除项目金额200%的部分，税率为50%。
增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。
如果无法提供购入发票，则土地增值税按照总价的3%进行计算。
卖家出售商铺时需要支付房地产交易手续费，费用为3元/平方米。
卖家出售商铺时需要支付印花税，费用为房屋产价的0.05%。
卖家出售商铺时需要支付产权登记费，费用为550元/户。
总结
商业门店出售时需要交纳的税费包括增值税、城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加、个人所得税、土地增值税、房地产交易手续费、印花税和产权登记费。具体税费金额需要根据实际转让收入、不动产购买原价、相关费用及当地的具体税率进行计算。建议在出售商铺前咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保准确计算和缴纳税费。
