套牌车的处理主要涉及 公安机关交通管理部门。具体处理措施包括：
使用套牌车的驾驶员将被公安机关交通管理部门一次扣12分。
公安机关交通管理部门会对套牌车进行收缴，并扣留该机动车。
对于使用套牌车的驾驶员，公安机关交通管理部门将处15日以下拘留。
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十六条，对于伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的，将处以二千元以上五千元以下罚款。
确定为被套牌的车辆，可撤销使用套牌期间发生的交通违法信息，并可申请换车牌号和行驶证。
车主发现车辆被套牌后，应立即向交管部门提出行政复议，并提供相关证据和情况说明，协助警方开展调查工作。
建议车主在发现车辆被套牌后，及时报警并提供相关证据，积极配合交警部门的调查和处理，以维护自身合法权益。
