店铺主要由国家市场监督管理总局进行管理。国家市场监督管理总局是国务院直属机构，为正部级，主要负责监督管理市场秩序。此外，根据店铺的具体类型和经营范围，还可能涉及其他相关部门的管理，例如：
负责个体工商户的登记、审核和营业执照的颁发，对经营活动进行管理和监督。
负责占道经营、户外广告等市容市貌的管理。
负责消防安全的监督和管理。
如果店铺经营食品、药品等，该部门将负责监督管理。
负责价格行为的监督和管理。
涉及产权问题的管理。
涉及安全问题的管理。
涉及环保相关问题的管理。
负责城市管理和综合执法，包括对超出店铺经营行为的监督。
建议店铺经营者了解并遵守相关法律法规，确保合法合规经营，同时积极与相关部门沟通，及时解决经营过程中遇到的问题。
