协议书公证的费用主要依据协议书的标的额等因素来确定。以下是一些具体的收费标准和计算方法：
标的额20万元以下，每件收取100元费用。
20万元至50万元部分，按0.8%的比例收取费用。
50万元至100万元部分，按0.6%收取。
100万元至200万元部分，按0.5%收取。
200万元至500万元部分，按0.4%收取。
500万元至1000万元部分，按0.3%收取。
超过1000万元部分，按0.1%收取费用。
每件收取公证费用200元，涉及财产关系的加倍收取。
标的额2万元以下，收取比例为1%。
2万元至10万元部分，收取0.6%。
10万元至100万元部分，收取0.4%。
100万元至300万元部分，收取0.2%。
300万元至500万元部分，收取0.1%。
500万元以上部分，收取0.05%。
80-500元。
按债务总额的0.3%收取。
200-5000元。
如证明出生、生存、死亡、身份、经历、学历、国籍、婚姻状况、亲属关系、未受刑事处分等，收费80元。
证明法人资格、收养、财产分割等，收费50-200元。
证明商标注册的，收费50元。
证明劳动保险金、养老金、子女助学金的，每件收费5元。
证明招标、拍卖、开奖的，收费100-150元。
建议
由于各地公证机构的收费标准存在一些细微差别，建议在具体办理公证时，直接咨询当地公证处或通过官方渠道获取最新的收费标准，以确保费用准确无误。
